O FORMAD acompanhou as primeiras discussões públicas do projeto ainda em 1997 quando os governos dos estados de Mato Grosso e Mato Grosso do Sul realizaram um workshop com o propósito de federalizar o projeto devido a falta de capacidade de endividamento dos estados. O FORMAD fez um documento com uma série de exigências que deveriam ser cumpridas para que apoiássemos a federalização.
De 1997 até 2000, o governo não manteve contato com o Formad. Somente em setembro do mesmo ano, o Formad retoma contato direto com o projeto buscando estudá-lo e avaliar se compensaria participar dos mecanismos de gestão e controle.
Deste então houve diversos momentos de discussão entre MT, MS, Bancos, Governo e representantes da sociedade civil, culminando em uma audiência pública (outubro de 2000) obtendo como resultado a consolidação e elaboração de um documento denominado “Mecanismo de Participação da Sociedade Civil Organizada no Programa Pantanal”.
Em setembro de 2003 o Formad realizou uma atualização do Programa gerando um subsídio (ver documento: um compêndio objetivo e complemento do Programa de desenvolvimento sustentável do Pantanal...) apresentado em duas plenárias.
